Echipa Națională de Management, condusă de Directorul General, raportează către membrii Consiliului Director al SOS Satele Copiilor România. Adunarea Generală alege Președintele și membrii Consiliului Director, care lucrează pe bază de voluntariat. Consiliul Director își asumă responsabilitatea pentru aprobarea politicilor, strategiei și bugetului organizației, pentru asigurarea unei bune conduceri a organizației, dar și pentru identificarea unor noi surse de strângere de fonduri și a unor noi parteneri. Echipa Națională de Management este responsabilă pentru implementarea deciziilor luate de Adunarea Generală și de Consiliul Director sub coordonarea Directorului General.